So wie man bei Google Maps nach bestimmten Straßen oder Orten suchen kann, kann man nun auch in der Zelle nach bestimmten Proteinen suchen: Wissenschaftler des MPI-CBG präsentieren eine Bilddatenbank, die die Lokalisation aller 27 Proteine der Rab-Familie wiedergeben. Zudem bietet die Datenbank Informationen darüber, wo diese Proteine exprimiert werden. Dafür wurden Daten in sechs verschiedenen Gewebearten und 23 Zelltypen generiert. Die Mikroskopiebilder wurden allesamt in der Fruchtfleige Drosophila melanogaster aufgenommen. Die Wissenschaftler präsentieren ihre Ergebnisse in der aktuellen Ausgabe der Zeitschrift "Developmental Cell".
Die 3D-Bilder sind offen zugänglich und können kostenlos durchsucht und heruntergeladen werden. Zudem sind alle Aufnahmen mit Anmerkungen versehen, die ebenfalls durchsucht werden können.
Die Rab-Proteine sind in wichtige Vorgänge im Verkehr zwischen Zellen involviert und dienen deshalb vielen Forscher als Ansatzpunkt, um bestimmte Transportrouten zu manipulieren.
Sebastian Dunst, Tom Kazimiers, Felix von Zadow, Helena Jambor, Andreas Sagner, Beate Brankatschk, Ali Mahmoud, Stephanie Spannl, Pavel Tomancak, Suzanne Eaton, Marko Brankatschk:
Endogenously Tagged Rab Proteins: A Resource to Study Membrane Trafficking in Drosophila
Developmental Cell, 4. Mai 2015