Vor zwei Jahren nahm die MOSAIC-Forschungsgruppe des MPI-CBG an einem weltweiten Wettbewerb teil: Im Rahmen des IEEE Symposium on Biomedical Imaging (ISBI) sollten Softwarelösungen verglichen werden, mit deren Hilfe man aus Mikroskopiebildern Informationen über die Bewegung von Objekten in der Zelle erhalten kann. Wie etwa bewegen sich Mikrotubuli, Viren oder Endosomen sowohl auf der zweidimensionalen Ebene wie auch im dreidimensionalen Raum fort?
Die Ergebnisse der Vergleichsstudie 14 internationaler Softwarelösungen wurden nun in der Zeitschrift „Nature Methods“ veröffentlicht und schafften es sogar auf die Titelseite. Ein Leitartikel und ein Kommentar beschäftigen sich in derselben Ausgabe ebenfalls mit dem Thema.
Der Algorithmus, den die Forscher des MPI-CBG entwickelten, ist in der Software MOSAICsuite gratis verfügbar und läuft auf den Plattformen ImageJ und Fiji. Er schneidet mit insgesamt 166 Platzierungen unter den Top 3 im Vergleichstest sehr gut ab: “Unser Algorithmus ist unter allen getesteten einer der schnellsten, vielseitigsten und leistungsfähigsten”, so der Leiter der MOSAIC-Gruppe, Ivo Sbalzarini.
Nicolas Chenouard, Ihor Smal, Fabrice de Chaumont, Martin Maška, Ivo F Sbalzarini, Yuanhao Gong, Janick Cardinale, Craig Carthel, Stefano Coraluppi, Mark Winter, Andrew R Cohen, William J Godinez, Karl Rohr, Yannis Kalaidzidis, Liang Liang, James Duncan, Hongying Shen, Yingke Xu, Klas E G Magnusson, Joakim Jaldén, Helen M Blau, Perrine Paul-Gilloteaux, Philippe Roudot, Charles Kervrann, François Waharte et al.:
Objective comparison of particle tracking methods
Nature Methods 11, 281–289 (2014)